最硬核回擊!國際著(zhù)名病毒進(jìn)化學(xué)家preprint發(fā)文反駁新冠病毒“人工合成”陰謀論

溫暖 5年前 (2020-02-19)

該論文分析可以提供證據表明,新冠病毒不是人工合成的。

關(guān)于新冠病毒“人工合成”陰謀論的最“硬核”反駁來(lái)了!

2月18日,Scripps研究所的著(zhù)名病毒進(jìn)化學(xué)家Kristian Andersen在preprint(預印本)的virological.org上發(fā)文反駁新冠病毒“人工合成”陰謀論。

作者通過(guò)對可用基因組序列數據的比較分析推導出新冠病毒的起源和早期進(jìn)化方法,并提供了有關(guān)新冠病毒基因組中顯著(zhù)特征的觀(guān)點(diǎn),基于此討論可能出現這些特征的場(chǎng)景要求。

最重要的是,該論文分析可以提供證據表明,新冠病毒不是人工合成的。

反駁新冠病毒是人工合成陰謀論的證據

首先論文對圖中描述的α和β冠狀病毒(Coronaviridae家族)的基因組進(jìn)行了比較,以此確定新冠病毒基因組所具有的兩個(gè)明顯特征:

1、基于結構模型和早期生化實(shí)驗可知,新冠病毒針對的是人與ACE2(宿主細胞受體血管緊張素轉化酶2)受體結合;

2、新冠病毒在S蛋白的2個(gè)亞基S1/S2交界處有一個(gè)預測的多堿基切割位點(diǎn)。

因此Andersen先從SARS-CoV與ACE2結合最重要的RBD(受體結合結構域)的6個(gè)氨基酸殘基,Y442、L4772、N479、D480、T487、Y4911入手。

他發(fā)現:新冠病毒的相應殘基為L(cháng)455、F486、S494、N501、Y505,與蝙蝠冠狀病毒RaTG13相比,有5個(gè)不同。新冠病毒S蛋白中第486位殘基的苯丙氨酸(F)對應于SARS-CoV Urbani株中的L472,但F486并不是計算生物學(xué)預測時(shí)該位置點(diǎn)最優(yōu)化的氨基酸選擇。

并且,新冠病毒的RBD中幾個(gè)關(guān)鍵氨基酸殘基與計算生物學(xué)預測的最適合結合人ACE2受體的氨基酸殘基也完全不同。

所以Andersen認為,從新冠病毒S蛋白結構特征來(lái)看,新冠病毒并非是通過(guò)算法所預測最優(yōu)化的,而更像是自然選擇的。

其次,新冠病毒第2個(gè)明顯的特征是在S蛋白的2個(gè)亞基S1/S2交界處Furin蛋白酶切割位點(diǎn)(RRAR),除了兩個(gè)堿性精氨酸和一個(gè)切割位點(diǎn)的丙氨酸之外,還插入了一個(gè)脯氨酸。

脯氨酸插入產(chǎn)生的轉角結構導致Furin蛋白酶切割位點(diǎn)側翼的S673、T678、S686發(fā)生添加O末端糖基化,而以前的β冠狀病毒均無(wú)Furin蛋白酶切割位點(diǎn)。

從SARS-CoV的體外實(shí)驗中可知,在S1/S2交界處突變出這樣的位點(diǎn),可以增強細胞-細胞融合,但并不影響病毒進(jìn)入。另外3個(gè)預測的O末端糖基化潛在功能還不清楚,但值得一提的是,它們可以產(chǎn)生一個(gè)“黏蛋白樣結構域”,該結構域可以屏蔽新冠病毒S蛋白上的潛在表位或者關(guān)鍵殘基。

但新冠病毒在體外培養體系中連續傳代極難同時(shí)獲得Furin蛋白酶切割位點(diǎn)和O末端糖基化。

第三個(gè)論據是病毒的宿主。新冠病毒與蝙蝠冠狀病毒RaTG13非常相似,所以蝙蝠是新冠病毒的宿主可能性很大。目前初步分析表明,非法進(jìn)口到廣東的馬來(lái)穿山甲可能是新冠病毒的中間宿主。

馬來(lái)穿山甲的冠狀病毒在6個(gè)關(guān)鍵RBD殘基上都與新冠病毒相同,但不同的是,馬來(lái)穿山甲的冠狀病毒不具有Furin蛋白酶切割位點(diǎn),這意味著(zhù)新冠病毒可能存在其他中間宿主,病毒在這些宿主身上形成了Furin蛋白酶切割位點(diǎn),然后才傳播給了人。

而病毒要在中間宿主身上實(shí)現這種進(jìn)化的話(huà),新冠病毒的中間動(dòng)物宿主必然具有極高的密度,這樣自然選擇才能快速發(fā)生。

因此從新冠病毒的S蛋白結構特征、早期進(jìn)化以及人工合成所具備的條件等方面來(lái)看,新冠病毒是自然的選擇,而不是合成的。

關(guān)于新冠病毒為“人工合成”的種種陰謀論

自疫情爆發(fā)以來(lái),有關(guān)新冠病毒是“人工合成”的論調層出不窮。

最早有人扒出曾與2015年發(fā)表在Nature上的一篇論文,并以此為據,稱(chēng)新冠病毒是人為制造的。

那么這個(gè)論文的內容是什么呢?

其實(shí)該論文闡述的是研究人員用SARS-CoV反向遺傳系統,生成并鑒定了一種類(lèi)似SARS新型冠狀嵌合病毒。

在體內實(shí)驗中證明,嵌合病毒在小鼠肺中的復制具有明顯的發(fā)病機理,能夠感染小鼠呼吸道細胞并引發(fā)嚴重急性呼吸系統綜合征。這項研究可以表明,蝙蝠種群中流行的病毒,可能會(huì )再次導致像SARS那樣的傳播風(fēng)險。

該研究由美國北卡羅萊納大學(xué)教堂分校主導,石正麗是該論文的作者之一,而她現在擔任中科院武漢病毒所研究員,于是這一巧合之下,不少陰謀論開(kāi)始滋生。

“疫情源頭是實(shí)驗室病毒泄露”、“病毒是美國人制造的”等傳言,流傳于網(wǎng)絡(luò )上,這篇論文成為了這類(lèi)謠言的論據。

與此同時(shí),不甘寂寞的印度也搞出了一個(gè)“大新聞”。

印度德里大學(xué)和印度理工學(xué)院的研究人員在bioRxiv的預印本上發(fā)表了一篇論文稱(chēng):“在新冠病毒突刺蛋白中發(fā)現4個(gè)插入序列,其與HIV-1gp120和Gag高度相似,而這4個(gè)插入序列均為新冠病毒獨有,在其他冠狀病毒中不存在。”

該論文將新冠病毒與引發(fā)“非典”疫情的類(lèi)似冠狀病毒的基因組進(jìn)行了對比,分析了二者存在差異的地方,然而發(fā)現了與艾滋病毒的關(guān)聯(lián)。論文摘要中寫(xiě)道:4個(gè)獨特的插入序列都與HIV-1關(guān)鍵結構蛋白中的氨基酸殘基具有同一性,這在自然界中不太可能是偶然的。

需要強調的是:bioRxiv網(wǎng)站不是學(xué)術(shù)期刊,在這上面刊登的論文,無(wú)需經(jīng)過(guò)同行審閱,可由學(xué)者自行刊發(fā)。

這篇論文發(fā)表后遭到了學(xué)術(shù)界強烈質(zhì)疑。

美國弗雷德·哈欽森癌癥研究中心研究員、全球聯(lián)合分析新冠病毒基因組項目的領(lǐng)導者之一的特雷弗·貝德福德就表示,“該論文不該發(fā)表。”因為從新冠病毒的基因上來(lái)看,根本沒(méi)有基因工程的證據,病毒變異完全符合自然進(jìn)化規律。

貝德福德還指出,該論文得出的結論在很多層面上都是錯誤的,所謂的4個(gè)插入序列并不是獨一無(wú)二的,它們也不是插入的,而是天然的。

最終這篇未經(jīng)審稿的論文以撤稿結束。

如今在A(yíng)ndersen的這篇論文發(fā)布后,眾多國際著(zhù)名病毒學(xué)家紛紛轉載這篇文章并支持駁斥了新冠病毒人工合成陰謀論。在科學(xué)的強有力證明下,一些在社交媒體上推崇新冠病毒人工合成論的人被瘋狂“打臉”后,刪除了他們的陰謀論。

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